협의회는 대한의사협회, 대한의학회, 한국의과대학장협의회, 치과대학장협의회, 기초의학회협의회, 한의대학교육협의회 등 관련 단체와 교육인적자원부, 보건복지부, 병무청 등 정부부처 관계자들로 구성됐다.
협의회는 상설기구로 운영되며, 내달부터 매월 1회 이상의 정기모임과 수시모임을 통해 기초의과학 육성과 관련한 의견을 수렴하고 주요 현안에 대해 협의하게 된다 협의회 위원장은 민간 위원 가운데 선임키로 내부 방침을 정한 것으로 알려졌다.
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