의약분업 이후에도 약사의 불법 의료행위가 여전한 것으로 조사돼 제도 시행의 취지를 무색케 하고 있다.
부산지역 전공의 의약분업평가단이 최근 부산지역 약국을 대상으로 의약분업 실태에 대한 조사를 실시한 결과 약국의 임의조제율이 73%에 달하며 58%는 문진행위를 하고 있는 것으로 드러났다.

의약분업평가단은 지난 8월 23일부터 보름 동안 총 320건의 원외처방전과 약국의 처방실태를 비교한 결과 약사가 문진 등 진단행위를 하고 처방약을 조제한 건수가 233건에 이른다고 밝혔다.
　
임의조제가 이뤄진 약품은 일반의약품이 62%였으며, 판매가 불가능한 전문의약품이 포함된 경우도 11%로 집계됐다. 생약과 한약재제가 포함된 경우도 32%나 돼 생약과 한약재에 대한 분류기준과 취급기준 마련이 시급한 것으로 지적됐다.

증상별 임의조제 비율은 두통이 85%로 가장 높았으며, 감기가 80%, 속쓰림과 불면증도 각각 76%로 높게 나타났다.
의약분업평가단은 이에 앞서 8월14일부터 열흘 동안 총 399건을 대상으로 실시한 대체조제 여부 조사결과에서도 대체 또는 변경조제가 26%나 됐다고 주장했다.